Migrena kronike është një ndërlikim i migrenës dhe karakterizohet nga fakti se pacienti vuan nga një dhimbje koke për më shumë se 15 ditë çdo muaj për shumë muaj. Dhimbja e kokës nuk ka domosdoshmërisht karakteristikat klasike të migrenës çdo ditë. Zakonisht ne kete situate te veshtire pacienti abuzon njekohesisht me barnat e dhimbjes ose me triptanet dhe vuan nga depresioni. Shumë herë trajtimi i zakonshëm farmaceutik-parandalues nuk mund ta përballojë këtë gjendje. Prej vitit 2012, administrimi i Botox-it të njohur për arsye mjekësore në këtë rast është miratuar dhe dhënë në Greqi nëpërmjet agjencisë së sigurimeve.
Procedura është si më poshtë: neurologu injekton Botox me shiringa insuline në 35-39 pika në të gjithë kafkën: ballë, anash (tempulli), poshtë në bazën e kafkës në pjesën e pasme dhe edhe më poshtë në qafë. Është një procedurë e standardizuar për të cilën është trajnuar neurologu që e kryen. Fondi jep dy shishe Botox çdo tre muaj pa kosto për pacientin, nëse kërkesa bëhet nga një neurolog i kualifikuar dhe pacienti vuan nga migrena kronike dhe ka dështuar të paktën dy trajtime të mëparshme me ilaçe.
Avantazhi i madh i këtij trajtimi është se Botox-i vepron vetëm lokalisht në vendet e injektimit dhe nuk e rëndon trupin. Efektet anësore që mund të ndodhin janë dhimbja e qafës në 10% dhe rënia e vetullave në pacientët 3%. Megjithatë, nëse shfaqet ndonjë efekt anësor, ai do të zhduket në 100%.